Gadget Diaryさん経由で知りました。

ついに購入！一週間使い倒してみたiPod記（ZDNet Japan）

　次に、初心者の無知からなのだが、iBookにあった音楽データのうち、iPodに転送したものを削除。これでHDDの空き容量は軽く20GBオーバーとなった。HDDが空くというのは非常に精神衛生にもよいもので、仕事の効率もよくなるから不思議なものだ。

　ところが悲劇はここから始まった。その後新たに読み込んだ音楽ファイルがあったために、再び、iPodに転送をしようと考えた。iPodを接続し、iTunesの環境設定を見ていると、自動でアップデートするという項目があるではないか。これは、iBookのiTunesファイルとiPodのファイルを比較し、新たにiTunesに増えたファイルを自動的にiPod転送してくれるものだと勝手な解釈をし、チェックをオンにして、環境設定を閉じた。ところが、ふとiPodのライブラリを見ると、下に表示されるiPodの空き容量が17GB近くになっているではないか！

　つまり、iTunesのデータフォルダーはiPodとは別に必ず確保しておかなければならないということ。時すでに遅し──18GBを消去してしまったのだ！

iTunes のライブラリを持ち運ぶための iPod なわけですから、普通 iTunes から削除ってしないと思うんですが…。

それに、iPod の環境設定で、手動で管理にすれば iTunes に曲を残していなくても iPod に曲は残せるわけですから、"iTunes のデータは iPod とは別に必ず確保しておかなければならない" というのは嘘ですよね。

記事中に初心者だから…と書いてありますが、こういう記事を書く場合は、ちゃんと調べた上で書いてほしいなぁと思います。